Phentrieve
Phentrieve unterstützt die Extraktion von Begriffen der Human Phenotype Ontology aus klinischem Freitext mithilfe von Sentence-Transformer-Modellen.
Relevante phänotypische Informationen liegen häufig als Freitext vor. Ihre Strukturierung als HPO-Begriffe erleichtert die Nutzung in genetischer Diagnostik und Forschungsabläufen.
Als Co-Developer entwickle ich Funktionen für die Verarbeitung klinischer Texte, die modellgestützte Phänotyp-Extraktion und die Integration strukturierter medizinischer Informationen. Darüber hinaus evaluiere ich die eingesetzten Methoden wissenschaftlich hinsichtlich ihrer Eignung für klinische und forschungsbezogene Anwendungen.